Kelas E harus mempraktikkan pelajaran mereka saat mereka menghadapi hotel menakutkan yang penuh dengan orang jahat - dan semuanya itu tanpa bantuan Koro Sensei.
Kelas E berlatih keras di bawah pengawasan seorang pembunuh profesional untuk mempersiapkan diri menghadapi pembunuhan di pulau itu. Sesampainya di sana, mereka harus memastikan semuanya berjalan lancar.
Kelas E memberi penembak jitu profesional banyak kesempatan untuk mengalahkan Koro Sensei, lalu mencoba memanfaatkan sisa perjalanan sekolah mereka ke Kyoto.
Para siswa menghadapi satu pembunuh terakhir sebelum bertemu dengan sosok bayangan yang menyandera obat virus sebagai ganti Koro Sensei.
Seorang guru bahasa asing baru datang ke 3-E dengan beberapa motif tersembunyi yang besar... di antara hal-hal lainnya. Akankah dia semakin dekat untuk membunuh Koro Sensei?