Rin, Shima, dan Izumo bertemu seorang anak laki-laki bernama Yohei dan mengetahui tentang "Iblis Laut Dalam" yang telah membunuh ayahnya.
Gerombolan iblis keluar dari Gerbang Gehenna! Dan para penyusup dari "Dunia Kosong" ini sekarang menyerang orang-orang di Kota Akademi True Cross tanpa pandang bulu! Sementara itu, di atap gedung sekolah, Rin telah diselamatkan oleh Suguro dan Shiemi dan mulai sadar. Yang dilihat Rin saat dia terbangun adalah...
Ernst berencana untuk memanggil Gerbang Gehenna dengan menggunakan darah Rin, putra Setan. Demi melindungi kakak laki-lakinya yang terluka, Yukio menawarkan diri untuk menggantikannya.
Ketika seorang Familiar Knights of the True Cross mengamuk, Yukio pun ditugaskan untuk menghadapi krisis tersebut.
Saat sidang berlanjut, Ordo tidak dapat memutuskan nasib Rin, karena Mephisto telah menyatakannya sebagai "senjata untuk melawan Setan." Tepat saat itu, sesuatu terjadi.