Makhluk yang menghancurkan bulan menjadi bulan sabit muncul di SMP Kunugigaoka dan dia memberi para siswa waktu satu tahun untuk membunuhnya!
Karma Akabane yang cerdas dan suka berperang, mantan teman sekelas Nagisa, bergabung dengan 3-E dan langsung terjun ke misi pembunuhan dengan kedua kakinya.
Koro Sensei mengungkap kelemahan utamanya, dan Terasaka mengganggu hari musim panas yang menyenangkan dengan upaya pembunuhan yang agak kelewat batas.
Sebelum upacara sekolah yang menyiksa dimulai, Okuda mencoba meracuni Koro Sensei dengan cara yang tak terduga... dengan hasil yang tak terduga.
Kelas E memberi penembak jitu profesional banyak kesempatan untuk mengalahkan Koro Sensei, lalu mencoba memanfaatkan sisa perjalanan sekolah mereka ke Kyoto.