Bersumpah untuk menjadi pengusir setan, Rin dibawa ke True Cross Academy oleh Mephisto yang misterius, seorang teman mendiang ayah mereka.
Dikonsumsi oleh kekuatan api selama pertarungannya dengan Amaimon, Rin menjadi gila. Ia mendapatkan kembali kendali atas dirinya sendiri setelah kekuatannya habis, tetapi kemudian ditangkap oleh Paladin saat ini, Angel.
Rin, Shima, dan Izumo bertemu seorang anak laki-laki bernama Yohei dan mengetahui tentang "Iblis Laut Dalam" yang telah membunuh ayahnya.
Setelah insiden serangan biara, Mephisto diberhentikan dari jabatannya sebagai direktur. Penasihat Tertinggi Ordo, Grigori, juga digulingkan, membuka jalan bagi Ernst untuk menjadi Paus.
Ketika seorang Familiar Knights of the True Cross mengamuk, Yukio pun ditugaskan untuk menghadapi krisis tersebut.